1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
akVNIKPLEDKILVQANEAETT
T ASGL
VIPdtakekpQEGTVVAVGPGRWDEdGEKRIPLDVAEGDTVIYSKY-GGTEIKYNGEEYLILSARDVLAVVSK MNIRPLHDRVIVKRKEVETK Sag GIVL TGS aaaksTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETK Sag GIVL TGS aaaKSTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETK Sag GIVL TGS aaaksTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKsaggi VLTGs AAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETK Sag GIVL TGS aaaKSTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETK SaggIVLTgsAAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKsaggi VLTGs AAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKsaggi VLTGs AAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKsaggi VLTGsA AAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETK SaggIVLTgsAAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKsaggi VLTGs AAAK sTRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGyGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA |
<= Base Loop
=>
<=R
=>
<=T=> |
(A) Structure of 1p3hN | (B)The D2 code of 1p3hN | (C) Alignment by DALI | (D)
Alignment blocks assigned by FATCAT |
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
--00000 00R 000000R
0 0R 0 00QBR 0 0
00RQBR 0G00 0 000R0 00R0 0
0 0QBRB 00O00 RG00R00 0000 RGR0 00
000
RR
0000000QABG0000-- AKVNIKP LED KILVQAN E AE T TTASG L V IPDTAK EKPQ E GTVVA VGPG R W DEDGE KRIPL DVAEGDT VIYS KYGG TE IKY NG EEYLILSARDVLAVVSK MNIRP LHDRVIVKRK E VE TKSA G GIVLT G S AAA KSTRG EVL A VGNG RI L ENGEV KPLDVKVGDI VIFN D GYGVKS EKI DNEEVLIMS ESDILAIVEA MNIRP LHDRVIVKRK E VE T KSA G GIVLT G S AAA KSTRG EVL A VGNG RI L ENGEV KPLDVKV GD IVIFND GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRP LHDRVIVKRK E VE T KSA G GIVLT GSA A A KS TRGEV L AV GN G RIL ENGEV KPLDVKVGDI VIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRP LHDRVIVKRK E VE T KSAG GIVLTGSA A AKSTRG EVL A VGNG RI L ENGEV KPLDVKV GD IVIF N DGYGVKSEKIDN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRP LHDRVIVKRK E VE T KSAG GIVLTGSA A AKSTRG EVL A VGNG RI L ENGEV KPLDVKV GD IVIF N DGYGVKSEKIDN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRP LHDRVIVKRK E VETKSA G GIV L TGS A AAKSTRG EVL A VGNG RILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVI VKRKEVETKSAGGIV L TG SAA A KST RGE V LAV GNGRILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVI VKRKEVETKSAGGIV L TG SAA A KST RGE V LAV GNGRILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVI VKRKEVETKSAGGIVL T G SAA A KST RGE V LAV GNGRILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVI VKRKEVETKSAGGIV L TG SAA A KST RGE V LAV GNGRILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVI VKRKEVETKSAGGIV L TG SAA A KST RGE V LAV GNGRILENG E VK PL DVKV GDIVIFN D GYGVKS EKI DN EEVLIMSESDILAIVEA |
<= Base Loop
=>
<= R
=>
<=T=> |
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
MNLJUSNLNMNGSKPRNMHaDSLMNHGBDOQKNLXKLGIMLHRJKLHaDEIMLLLPQTYUSLXMXKPOUSLLTTTUFSLXMMXKHBBQGILNT----- NIKPLEDKILVQAN EAETTT A SGLVIPDTAKEKPQEGTVVAVGPGRWDEDGEKRIPLDVAEGDTVIYS KYGGTEIKYNGEEYLILSARDVLAV NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EVETKS AGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI MNIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRKEVETK-S AGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI NIRPLHDRVIVKRK EV ETKSAGGIVLTG SAAAKSTRGEVLAVGN GRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAI |
<= Base Loop
=>
<=R
=>
<=T=> |
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
AKVNIKPLEDKILVQANEAETTT ASGLVIPDTAKEKPQEGTVVAVGPGRWDEDGEKRIPLDVAEGDTVIYSKYG GTEIKYNGEEYLILSARDVLAVVSK MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGI VLTGSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKR-KEVETKSAGGIV LTGSAAAK STRGEVLAVGNGRILE NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKR-KEVETKSAGGIV LTGSAAAK STRGEVLAVGNGRILE NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLT GSAAAK STRGEVLAVGNGRILEN GEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA |
<= Base Loop
=>
<=R
=>
<=T=> |
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
AKVNIKPLEDKILVQANEAET
TTASGLVIPDTAKEK P
QEGTVVAVGPGRWD EDGEKRIPLDVAEGDTVIYSKY G GTEIKYNGEEYLILSARDVLAVVSK MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTG SA A AKSTRGEVLAVGNGRIL E NGEVKPLDVKVGDIVIFNDG YGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTG SA A AKS TRGEVLAVGNGRIL E NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTG SA A AKS TRGEVLAVGNGRIL E NGEVKPLDVKVGDIVIFNDG YGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTG SA A AKSTRGEVLAVGNGRIL E NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTG SA A AKSTRGEVLAVGNGRIL E NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEV ETKSAGGIVLTGSA A AKSTRGEVLAVGNGRILENGE VKPLDVKVGDIVIFNDGYG VKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA |
<= Base Loop
=>
<=R
=>
<=T=> |
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10 1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890 |
|
1p3hN 1aonO 1aonP 1aonS 1pf9O 1pf9R 1svtO 1pcqO 1pcqP 1pcqQ 1pcqR 1pcqS |
VNIKPLEDKILVQANEA-ETTT----ASGLVIPDTAKEKPQEGTVVAVGPGRWDEDGEKRIPLDVAEGDTVIYSKYG-GTEIKYNGEEYLILSARDVLAVVSK MNIRPLHDRVIVKRKEV-ETKSAGGIVLTGSAAAK----STRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111-1111 111111111 1111111111111111 111111111111111111111 1111111111111111111111111 MNIRPLHDRVIVKRKEV-ETKSAGGIVLTGSAAAK----STRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111-1111 111111111 1111111111111111 111111111111111111111 1111111111111111111111111 MNIRPLHDRVIVKRKEV-ETKSAGGIVLTGSAAAK----STRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111-1111 111111111 1111111111111111 111111111111111111111 1111111111111111111111111 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSA----GGIVLTGSAAAKS-TRGEVLAVGNGRILE-NGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA 11111111111111111 2222----2222222222222 333333333333333 33333333333333333333 33333333333333333333333333 |
<= Base Loop
=>
<= R
=>
<=T=> |