• Backbone structures are obtained using ProteinViewer, where N-terminal is colored red and C-terminal blue.
• Superpositions are computed by the DaliLite server.
• Z-Score is a measure of quality of the alignment. As a general rule, above 20 means the two structures are definitely homologous, between 8 and 20 means the two are probably homologous, between 2 and 8 is a grey area, and a Z-Score below 2 is not significan
  
• AR: number of Aligned Residues (=length of the alignment).
• RMSD: superimposed Root Mean Square Deviation, calculated using all structurally equivalent C-alpha atoms.
• SI: Sequence Identity between the two chains
• P-value is used in FATCAT to evaluate the significance of structural similarity detected by FATCAT, the probability of observing a greater score. (Structure pairs with probability < 0.05 are significantly similar)
  
• EP: number of Equivalent Positions. Number of residue pairs that are structurally equivalent (= length of the alignment, similarity).
• Twist: number of rigid-body movements around pivot points (hinges) introduced in the reference protein.
• LCS: longest common subsequence of the two D2 code sequences.
• Click the images to view larger image.
• See the bottom for brief explanation of the D2 codes. 

Query chain: d2hkja1 (78 residues)
		Residue: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 Code: --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R--

Superposition (or the target chain)		DaliLite result	FATCAT result		D2 code sequences
D2 LCS ratio: 0.85 (=63/74)
d1tdza1 (res1 - res78)
		Z-Score: 11.1 AR: 74 RMSD: 1.8A SI:  23%	P-Value: 0.00 EP: 74 RMSD: 1.83A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0Q-BG0QAAAAAAAAB--GR00QAAAAB-B-0-00QAAAAAAAAABR00QB00QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: GPEPTYEDFDEKLFREKLRKSTKKIKPYLLEQTLVAGLGNIYVDEVLWLAKIHPEKETNQLIESSIHLLHDSIIEILQ D2 : --0RGQB1G0QAAAAAAAABGR00QAAAAABRQB00000QAAAAAAAAABR00QB00QABG0QAAAAAAAAAAAAA-- LCS: --0--QB-G0QAAAAAAAABGR00QAAAA-B--B000--QAAAAAAAAABR00QB00QAB-0QAAAAAAAAAAA----
D2 LCS ratio: 0.82 (=61/74)
d2bo4a1 (res256 - res333)
		Z-Score: 1.1 AR: 45 RMSD: 3.3A SI:  7%	P-Value: 0.07 EP: 48 RMSD: 2.31A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAAAA-B--GR00QAAAAB--G0---QAAAAAAAAAB-00--00QAB0-QAAAAAAAAAAA-0R-- Tgt: HRVPVHIAERVGYDVEATLHRLMQHWTPRQVELLELFTTPVREGLRTCQRRPAFNFMDEMAWAATYHVLLEHFQPGDP D2 : --00QAAABG0000QAAAAAAABGR00QAAAAAAABG0QAAAAAAAAAB00001QAB0QAAAAAAAAAAAB0000R-- LCS: --00QA--BG0---QAAAAAAABGR00QAAAA---BG0QAAAAAAAAAB0000-QAB0QAAAAAAAAAAA-0---R--
d1ee8a1 (res1 - res 78)
		Z-Score: 10.8 AR: 74 RMSD: 1.8A SI:  24%	P-Value: 0.00 EP: 74 RMSD: 1.83A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0Q-BG0QAAAAAAAAB--GR0-QAAAAB-B-0R00QAAAAAAAAABR00Q-0-QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: GPEPLSEAFAFPGFFRGLKESARPLKALLLDQRLAAGVGNIYADEALFRARLSPFRPARSLTEEEARRLYRALREVLA D2 : --0QBGQBB0QAAAAAAAABGRG0QAAAAABQAB00R00QAAAAAAAAABR00QGG0QABG0QAAAAAAAAAAAAA-- LCS: --0QBG---0QAAAAAAAABGR-0QAAAA-B--B0-R00QAAAAAAAAABR00Q--0QAB-0QAAAAAAAAAAA----
d1k82a1 (res1 - res78)
		Z-Score: 11.4 AR: 74 RMSD: 1.7A SI:  22%	P-Value: 0.00 EP: 74 RMSD: 1.70A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0Q-BG0QAAAAAAAAB--GR0-QAAAAB--G0R00QAAAAAAAA-BR00QB0-QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: GPEPLSDDFNGEYLHQKCAKKKTAIKPWLMDNKLVVGVGNIYASESLFAAGIHPDRLASSLSLAECELLARVIKAVLL D2 : --0QBGQBG0QAAAAAAAABGRG0QAAAABGQAB00R00Q9AAAAAAAABR00QBG0QABG0QAAAAAAAAAAAAA-- LCS: --0QBG---0QAAAAAAAABGR-0QAAAABG---0-R00Q-AAAAAAAABR00QB-0QAB-0QAAAAAAAAAAA----
d1r2za1 (res1 - res78)
		Z-Score: 11.3 AR: 74 RMSD: 1.7A SI:  22%	P-Value: 0.00 EP: 74 RMSD: 1.73A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0Q-BG0QAAAAAAAA-0RG-0-QAAAAB--G0-00QAAAAAAAAABR00QB0-QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: QLTDEQKNEFKAAFDIFIQDAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRCMKDD D2 : --0QBGQBG0QAAAAAAAAG0RG0QAAAABGQAB00000QAAAAAAAAABR00QBG0QABG0QAAAAAAAAAAAAA-- LCS: --0QBG---0QAAAAAAAA-0RG0QAAAABG-----000QAAAAAAAAABR00QB-0QAB-0QAAAAAAAAAAA----
D2 LCS ratio: 0.81 (=60/74)
d1l2ta_ (res90 - rs167)
		Z-Score: 3.8 AR: 57 RMSD: 3.0A SI:  18%	P-Value: 0.00 EP: 57 RMSD: 3.08A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAAAB0RG-00QAAAA---------AAAAAAAAABR00QB0-QAB0-QAAAAAAAAAAA-0R-- Tgt: QQFNLIPLLTALENVELPLIFKYRGAMSGEERRKRALECLKMAELEERFANHKPNQLSGGQQQRVAIARALANNPPII D2 : --RR00QBG0QAAAAAAAAAB0RG0000QAAAAAAAAAAAAABR00QABQBG0QABG0QAAAAAAAAAAABPBR0R-- LCS: ----00QBG0QAAAAAAAA-B0RG00--QAAAAAAAAAAAAABR00Q-B---0QAB-0QAAAAAAAAAAA----0R--
D2 LCS ratio: 0.80 (=59/74)
d1avca1 (res108 - res185)
		No Significant Similarities	P-Value: 0.05 EP: 68 RMSD: 2.41A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: -----ABG0QAAAAAAAAB0RG-0-QAAAAB--G0-0-QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAA-0R-- Tgt: EILASRTNEQIHQLVAAYKDAYERDLEADITGDTSGHFRKMLVVLLQGTREEDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGT D2 : --AB0G0QAAAAAAAAAAAAB0RG0QAAAAAABG00QAAAAAAAAABRR00000000QAAAAAAAAAAAAB0QBGR-- LCS: --AB-G0Q----AAAAAAAAB0RG0QAAAA--BG00QAAAAAAAAABR-000000--QAAAAAAAAAAA--0---R--
d1dm5a_ (res105 - res182)
		No Significant Similarities	P-Value: 0.07 EP: 73 RMSD: 2.89A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0-A-G0QAAAAAAAAB0RG-0-QAAAAB0--0-0-QAAAAAAAAABR0-QB00---00QAAAAAAAAAAA-0--- Tgt: NALIDILCTQSNAQIHAIKAAFKLLYKEDLEKEIISETSGNFQRLLVSMLQGGRKEDEPVNAAHAAEDAAAIYQAGEG D2 : --AAA01A0G0QAAAAAAAAAAAAB0RG0QAAAAAAB000QAAAAAAAAABRR0RQB0000QAAAAAAAAAAAAB0-- LCS: -----0-A-G0Q----AAAAAAAAB0RG0QAAAA--B000QAAAAAAAAABR-0-QB0000QAAAAAAAAAAA--0--
d1dmra2 (res264 - res341)
		Z-Score: 0.3 AR: 45 RMSD: 6.6A SI:  4%	P-Value: 0.27 EP: 64 RMSD: 2.96A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00----0QAAAAAAA-B0RG-00QAAAA-0--0R00QAAAAAAAAABR00--00QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: ANYTSGFDKFLPYLDGETDSTPKTAEWAEGISGVPAETIKELARLFESKRTMLAAGWSMQRMHHGEQAHWMLVTLASM D2 : --0000QAAAAAAABRQB0RG0R0QAAAAA00R00QAAAAAAAAAAAB0R0000001QAABG0RQAAAAAAAAAAA-- LCS: ---000QAAAAAAAB---0RG0-0QAAAA-00R00QAAAAAAAAA--B-R0000---QA-B-0-QAAAAAAAAAAA--
d1e94e_ (res271 - res348)
		Z-Score: 1.1 AR: 34 RMSD: 1.9A SI:  12%	P-Value: 0.00 EP: 49 RMSD: 1.78A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAA---B-RG-00QAAAAB0-G0R0-QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: ASGAFQIAKPSDLIPELQGRLPIRVELQALTTSDFERILTEPNASITVQYKALMATEGVNIEFTDSGIKRIAEAAWQV D2 : --0RRQB00QABG0QAAAAABRG00000000QAAAAAAB10G0R0QAAAAAAAAAABR000000QAAAAAAAAAAA-- LCS: -------00QABG0QAAAAABRG------00QAAAA--B-0G0R0QAAAAAAAAA-BR000000QAAAAAAAAAAA--
d1g41a_ (res197 - res274)
		Z-Score: 1.1 AR: 35 RMSD: 2.3A SI:  9%	P-Value: 0.04 EP: 49 RMSD: 1.82A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAA---B-RG-00QAAAAB0-G0R0-QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: ASGAFQVARPSDLIPELQGRLPIRVELTALSAADFERILTEPHASLTEQYKALMATEGVNIAFTTDAVKKIAEAAFRV D2 : --0RRR0G0QABG0QAAAAABRG00000000QAAAAAAB00G0R0QAAAAAAAAAABR000000QAAAAAAAAAAA-- LCS: ------0-0QABG0QAAAAABRG------00QAAAA--B0-G0R0QAAAAAAAAA-BR000000QAAAAAAAAAAA--
d1gdea_ (res5 - res82)
		No Significant Similarities	P-Value: 0.23 EP: 57 RMSD: 2.87A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: -----ABG0QAAAAAAAAB--GR00Q----B0-G0R00QAAAAAAAAABR00--0-Q-B00QAAAAAAAAAAA-0R-- Tgt: RLELVSASEIRKLFDIAAGMKDVISLGIGEPDFDTPQHIKEYAKEALDKGLTHYGPNIGLLELREAIAEKLKKQNGIE D2 : --ABG000QAAAAAAAAABG0R000QB0RG0RG000QAAAAAAAAAAABRRGG000QB00QAAAAAAAAAAAAB0R-- LCS: --ABG0--QAAAAAAAA-BG-R00-QB0-G0R-00-QAAAAAAAAA--BR---000QB00QAAAAAAAAAAA--0R--
d1ioma_ (res143 - res220)
		Z-Score: 0.4 AR: 30 RMSD: 2.8A SI:  3%	P-Value: 0.08 EP: 58 RMSD: 3.30A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAA-B0RG-00QAAA----------AAAAAAAAABR00--00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- Tgt: IPPREDLSHAANFLYMANGVEPSPEQARLMDAALILHAEHGFNASTFTAIAAFSTETDLYSAITAAVASLKGPRHGGA D2 : --00QBG0QAAAAAAAB0RG000QAAAAAAAAAAAABR000R0QAAAAAAAAAABR00QAAAAAAAAAAABGQB0R-- LCS: --00QBG0QAAAAAAAB0RG00-QAAAAAAAAAAAABR000-0QA---------B-00QAAAAAAAAAAA-G--0R--
d1jpua_ (res254 - res331)
		Z-Score: 0.5 AR: 34 RMSD: 2.9A SI:  15%	P-Value: 0.04 EP: 67 RMSD: 2.81A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAAAAA--------AAAAB--G0-00QAAAAAAAAABR00--00QAB00QAAAAAAAAAA--0R-- Tgt: GFTALEGEIHHLTHGEKVAFGTLVQLALEEHSQQEIERYIELYLCLDLPVTLEDIKLKDASREDILKVAKAATAEGET D2 : --ABG00QAABG0QAAAAAAAAAAAAABG000QAAAAAAAAAAAABR0000QAABRR0R00QAAAAAAAAAAB00R-- LCS: -----00QA-BG0QAAAAAAAAAAAA-BG000QAAAAAAAAA---BR0000QA-B--0-0-QAAAAAAAAAA-0-R--
d1ofha_ (res172 - res249)
		Z-Score: 0.1 AR: 35 RMSD: 2.3A SI:  9%	P-Value: 0.04 EP: 49 RMSD: 1.81A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAA---B-RG-00QAAAAB0-G0R0-QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: ASGAFQVARPSDLIPELQGRLPIRVELTALSAADFERILTEPHASLTEQYKALMATEGVNIAFTTDAVKKIAEAAFRV D2 : --0RRR0G0QABG0QAAAAABRG00000000QAAAAAAB10G0R0QAAAAAAAAAABR000000QAAAAAAAAAAA-- LCS: ------0-0QABG0QAAAAABRG------00QAAAA--B-0G0R0QAAAAAAAAA-BR000000QAAAAAAAAAAA--
d1uf2a_ (res636 - res713)
		Z-Score: 0.2 AR: 36 RMSD: 3.7A SI:  11%	P-Value: 0.28 EP: 34 RMSD: 3.34A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QAB-0QAAAAAAAAB0RGR00QAAA--0BG-R00QAAAAAAA--B-00--00---00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: KLGRNPADIFHLEEVFKVIEEIVSVLVQQKIDVRKYFTESMRSGSFSKPRWDNFLRRPVAQRLPNLYSVIMTQADHVY D2 : --R00QAB000QAAAAAAAAAHAAAB0RGR00QAAAG0R0QBGR000QAAAAAAABG0000000QAAAAAAAAAAA-- LCS: ---00QAB0--Q----AAAAA-AAAB0RGR00QAAA-0---BGR00-QAAAAAAAB-000000-QAAAAAAAAAAA--
d1wh6a_ (res3 - res80)
		Z-Score: 1.2 AR: 45 RMSD: 3.4A SI:  11%	P-Value: 0.04 EP: 65 RMSD: 2.60A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QAB-0QAAAAAAAAB-R--00QAAAAB0B--R00QAAAAAAA--B-00--00QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: SGSSGQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWL D2 : --QB00QAAAB0000RQAAAAAAAAAAAAABR00QAAAAB0QBR00QAAAAAAAB0000QABG0QAAAAAAAAAAA-- LCS: ----00QA--B0----Q-----AAAAAAAABR00QAAAAB0-BR00QAAAAAAAB0000QAB-0QAAAAAAAAAAA--
d1y1xa_ (res10 - res87)
		Z-Score: 3.7 AR: 64 RMSD: 3.6A SI:  14%	P-Value: 0.01 EP: 60 RMSD: 3.08A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAA-B-R-R00QAAAAB--G0R00QAAAAAAAAABR--QB00QA----AAAAAAAAAAA----- Tgt: SARHMNDNQELMEWFRAVDTDGSGAISVPELNAALSSAGVPFSLATTEKLLHMYDKNHSGEITFDEFKDLHHFILSMR D2 : --RR00QBG0QAAAAAAABQBRRRG00QAAAAAABG00RG000QAAAAAAAAABRQBRRRG00QAAAAAAAAAAAA-- LCS: ----00QBG0QAAAAAAAB--RR--00QAAAA--BG0-R-00-QAAAAAAAAABRQB----00QAAAAAAAAAAAA--
D2 LCS ratio: 0.78 (=58/74)
d1a59a_ (res145 - res222)
		Z-Score: 0.4 AR: 30 RMSD: 2.8A SI:  7%	P-Value: 0.14 EP: 57 RMSD: 2.92A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAA-B0RG-00QAAAAB0--0-00QAAAAAAAAA---------AB00QAAAAAAAAAAAG0--- Tgt: LIEPREDLDYSANFLWMTFGEEAAPEVVEAFNVSMILYAEHSFNASTFTARVITSTLADLHSAVTGAIGALKGPLHGG D2 : --000QBG0QAAAAAAAB0RG000QAAAAAAAAAAAABJ00030QAAAAAAAAAABR00QAAAAAAAAAAABGQB0-- LCS: ---00QBG0QAAAAAAAB0RG00-QAAAA--------B-000-0QAAAAAAAAAAB-00QAAAAAAAAAAA-G--0--
d1afwa2 (res22 - res99)
		Z-Score: 0.2 AR: 37 RMSD: 6.5A SI:  8%	P-Value: 0.21 EP: 69 RMSD: 3.10A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ----QAB---AAAAAAAAB-R--00QA---B--G0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: MGVGPAYAIPKVLEATGLQVQDIDIFEINEAFAAQALYCIHKLGIDLNKVNPRGGAIALGHPLGCTGARQVATILREL D2 : --BQAB1AAAAAAAABR00QABGR00R000R0QAAAAAAAAABR00QABGRQB00QBAB00R0Q9AAAAAAAAAAA-- LCS: ---QAB-AAAAAAAABR00QABG-0-R00---QAAAAAAAAABR00Q-B----00Q-AB00--Q-AAAAAAAAAAA--
d1axna_ (res115 - res192)
		Z-Score: 0.1 AR: 30 RMSD: 4.2A SI:  23%	P-Value: 0.08 EP: 69 RMSD: 3.62A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: -----ABG0QAAAAAAAAB0RG-0-QAAAAB0--0-0-QAAAAAAAAABR00--00---0-QAAAAAAAAAAAG0--- Tgt: EILTTRTSRQMKDISQAYYTVYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKQDAQILYKAGENRWGT D2 : --AABG0QAAAAAAAAAAAAB0RG0QAAAAAAB000QAAAAAAAAABRR00R0RG00QAAAAAAAAAAAAB0QBG0-- LCS: ---ABG0Q----AAAAAAAAB0RG0QAAAA--B000QAAAAAAAAABR-00-0--00QAAAAAAAAAAA-----G0--
d2dcna1 (res113 - res190)
		Z-Score: 0.4 AR: 34 RMSD: 3.6A SI:  12%	P-Value: 0.17 EP: 55 RMSD: 3.10A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAA----B--GR00QAAA-B------0QAAAAAAAAABR00--00QAB00QAAAAAAAAAAA-0R-- Tgt: SKLSPEDVDEEYVKSADLVHSSGITLAISSTAKEAVYKAFEIASNRSFDTNIRLKLWSAEEAKREILKLLSKFHLKFL D2 : --00QABG0QAAAABGR00000QAAAHB0QAAAAAAAAAAABGR00000RR00QAB00QAAAAAAAAAAAAB000R-- LCS: --00QABG0QAAAABGR00---QAAA-B0QAAAAAAAAA--B-R0000-----QAB00QAAAAAAAAAAA--0--R--
d2f8ja1 (res22 - res99)
		Z-Score: 0.2 AR: 37 RMSD: 5.7A SI:  22%	P-Value: 0.13 EP: 54 RMSD: 2.41A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00---G0QAAAAAAAAB--G-0-QAAA-B--G-R00QAAAAAAAAAB-00Q-0-QAB00QAAAAAAAAA--G0R-- Tgt: TYLALNENPFPFPEDLVDEVFRRLNSDALRIYYDSPDEELIEKILSYLDTDFLSKNNVSVGNGADEIIYVMMLMFDRS D2 : --RG0R00RG000QAAAAAAAABG0QAAABGR003O0QAAAAAAAAAB00QGG0QABG000R0QAAAAAAAAAG0R-- LCS: ------00-G0--QAAAAAAAABG0QAAABGR00---QAAAAAAAAAB00Q--0QAB-00---QAAAAAAAAAG0R--
d1fr2a_ (res2 - res79)
		Z-Score: 1.9 AR: 55 RMSD: 3.6A SI:  7%	P-Value: 0.10 EP: 67 RMSD: 3.47A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0QABG0QAAAAAAAAB-RGR0-QAAAA---------AAAAAAAAABR0-QB0-QA-00QAAAAAAAAAAAG-R-- Tgt: KHSISDYTEAEFLQLVTTICNADTSSEEELVKLVTHFAEMTEHPSGSDLIYYPKEGDDDSPSGIVNTVKQWRAANGKS D2 : --0QABG0QAAAAAAAAAAABRRGR0QAAAAAAAAAAAAABR0QB0QAAG00000R00RGQAAAAAAAAAAAAAGR-- LCS: --0QABG0QAAAAAAAA---BR-GR0QAAAAAAAAAAAAABR0QB0QA--00--------QAAAAAAAAAAA--GR--
d2fxua2 (res101 - res178)
		Z-Score: 0.1 AR: 34 RMSD: 4.4A SI:  29%	P-Value: 0.10 EP: 44 RMSD: 2.60A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QAB---AAAAAAAAB0RG-00QAAAAB--G0---QAAAAAAA--B-00--00QAB00QAAAAAAAAAA-G0--- Tgt: VITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPST D2 : --000QABAAAAAAAB0QAABR0RG00QAAAAAAAAABG0QAAAAAAABG00000QABB00RQAAAAAAAAAABG0-- LCS: ---00QABAAAAAAA---A-B-0RG00Q-----AAAABG0QAAAAAAAB-0000-QAB-00-QAAAAAAAAAA-G0--
d1g6ha_ (res89 - res166)
		Z-Score: 3.9 AR: 54 RMSD: 2.6A SI:  22%	P-Value: 0.01 EP: 68 RMSD: 3.24A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: -----ABG0QAAAAAAAAB0RG-0-QAAAAB--G-R00-AAAAAAAAABR--QB0-QAB0-QAAAAAAAAAAA----- Tgt: QPLKEMTVLENLLIGEICPGESPLNSLFYKKWIPKEEEMVEKAFKILEFLKLSHLYDRKAGELSGGQMKLVEIGRALM D2 : --AABG0QAAAAAAAABR0RG0QAAAAABGR000001AAAAAAAAAAAABRRQABQBG0QABG0QAAAAAAAAAAA-- LCS: ---ABG0QAAAAAAAAB-0RG0QAAAA-BGR00-------AAAAAAAAABR-Q-B---0QAB-0QAAAAAAAAAAA--
d1k3xa1 (res1 - res78)
		Z-Score: 8.7 AR: 72 RMSD: 2.3A SI:  21%	P-Value: 0.00 EP: 73 RMSD: 2.43A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAA-B--G-0-QAAA-B--G0R00QAAAAAAAAABR00QB0-QAB0-QAAAAAAAAA------- Tgt: VGPDVLDPNLTPEVVKERLLSPRFRNRQFAGLLLDQAFLAGLGNYLRVEILWQVGLTGNHKAKDLNAAQLDALAHALL D2 : --00QBGQBG0QAAAAAAABGQB1QBG0QBAAABGQAG00R00QAAAAAAAAABR00QBG0QABG0QAAAAAAAAA-- LCS: --00QBG---0QAAAAAAA------BG0Q-AAABG---0-R00QAAAAAAAAABR00QB-0QAB-0QAAAAAAAAA--
d1muca1 (res115 - res192)
		Z-Score: 0.1 AR: 34 RMSD: 5.9A SI:  0%	P-Value: 0.07 EP: 63 RMSD: 2.42A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00Q-BG0QAAAAAAAAB-R-R00QAA------0-00QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAAG-R-- Tgt: PIMADESIESVEDAFSLAADGAASIFALKIAKNGGPRAVLRTAQIAEAAGIGLYGGTMLEGSIGTLASAHAFLTLRQL D2 : --000QBGR0QAAAAAAAABRR0R00000QAA000QAAAAAAAAAAAABR0000000RR00QAAAAAAAAAAABGR-- LCS: ---00QBG-0QAAAAAAAABRR0-0----QAA000QAAAAAAAAA---BR000000-----QAAAAAAAAAAA-GR--
d1pzla_ (res102 - res179)
		Z-Score: 0.7 AR: 36 RMSD: 5.5A SI:  8%	P-Value: 0.10 EP: 60 RMSD: 2.76A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0QAB-0QAAAAAAAA-----00QAAAAB----R00QAAAAAAAAAB-0-QB00---00QAAAAAAAAAAAG0R-- Tgt: RHCPELAEMSRVSIRILDELVLPFQELQIDDNEYAYLKAIIFFDPDAKGLSDPGKIKRLRSQVQVSLEDYINDRQYDS D2 : --0QAB0QAAAAAAAAA001QAAAAABR00QAAAAAAAAAAAB0QB00R0R0QAAAAAAAAAAAAAAAAAAABG0R-- LCS: --0QAB0QAAAAAAAA-00-QAAAA-BR00QAAAAAAAAA--B0QB00-0-0QAAAAAAAAAAA---------G0R--
d2q4ca1 (res96 - res173)
		Z-Score: 0.1 AR: 34 RMSD: 5.6A SI:  6%	P-Value: 0.07 EP: 65 RMSD: 2.69A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ----QABG0QAAAAAAAAB0RG-0-QAAAAB--G0-0-QAAAAAAAAABR00--00---00QAAAAAAAAAAA----- Tgt: SSNQVLMEVACTRTSTQLLHARQAYHARYKKSLEEDVAHHTTGDFRKLLVSLVTSYRYEGDEVNMTLAKQEAKLVHEK D2 : --GRQAAAAA1BG0QAAAAAAAAAAAAB0RG0QIAAAAGBG00QAAAAAAAAABGR0000R00RQAAAAAAAAAAA-- LCS: ----Q----A-BG0Q----AAAAAAAAB0RG0Q-AAAA-BG00QAAAAAAAAAB-R0000-00-QAAAAAAAAAAA--
d1r2ua_ (res11 - res88)
		Z-Score: 3.0 AR: 51 RMSD: 2.8A SI:  6%	P-Value: 0.02 EP: 63 RMSD: 3.31A Twist: 1		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: ---0QA----AAAAAAAAB0R-R00QAAAAB0--0-00QAAAAAAAAABR--QB00---00QAAAAAAAAAAAG---- Tgt: QLTDEQKNEFKAAFDIFIQDAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRCMKDD D2 : --0QAAAAAAAAAAAAABR00RR0000QAAAAAAAAAB00000QAAAAAAAAABRQBR00G00QAAAAAAAAAAAG-- LCS: --0QAAAAAAAAA----B-0-RR00--Q-----AAAAB0000-QAAAAAAAAABRQB-00-00QAAAAAAAAAAAG--
d1rlra1 (res3 - res80)
		Z-Score: 2.1 AR: 39 RMSD: 2.0A SI:  8%	P-Value: 0.01 EP: 45 RMSD: 3.03A Twist: 0		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QA----AAAAAAAAB0RGR00QAAAAB--G0-00QAAAAAAAAAB-00QB0-Q----QAAAAAAAAAAA----- Tgt: GSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHL D2 : --RR0R01QAAAAAAAAAB0RG0R00QAAAAAAAAABG0QB00QAAAAAAAAAAAAAB00QB0QQAAAAAAAAAAA-- LCS: ----0-0-QAAAAAAAAAB0RG-R00QAAAA-----BG0--00Q----AAAAAAAAAB00QB0QQAAAAAAAAAAA--
d1v71a1 (res38 - res115)
		Z-Score: 0.3 AR: 34 RMSD: 6.7A SI:  0%	P-Value: 0.19 EP: 62 RMSD: 2.80A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAAAAA---G-00QAAAAB0--0-00QAAAAAAAAABR00--00Q-B00QAAAAAAAA-------- Tgt: VFFKCENFQKMGAFKFRGALNALSQLNEAQRKAGVLTFSSGNHAQAIALSAKILGIPAKIIMPLDAPEAKVAATKGYG D2 : --000QABG0R0GQAAAAAAAAAAG00QAAAAB000000RGQAAAAAAAAAAABR00000000QB00QAAAAAAAA-- LCS: ---00QABG0---QAAAAAAAA--G00QAAAAB0000----QAAAAAAAAA--BR----0000QB00QAAAAAAAA--
d1wh4a_ (res10 - res87)
		Z-Score: 0.3 AR: 45 RMSD: 3.9A SI:  9%	P-Value: 0.11 EP: 68 RMSD: 3.87A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAAAAAB--GR--QAAAAB0B-0R00QAAAAAAAAAB-00--00QA----AAAAAAAAA---0--- Tgt: KPLTPSTYIRNLNVGILRKLSDFIDPQEGWKKLAVAIKKPSGDDRYNQFHIRRFEALLQTGKSPTCELLFDWGTTNCT D2 : --00QBG0QABG0QAAAAAAAB1ABGRRQAAAAAABG00QBR00R00QAAAAAAAAAAB0000QAAAAAAAAAAB0-- LCS: ---0---0QABG0QAAAAAAA--ABGR-QAAAA--B-0--B-0-R00QAAAAAAAAA-B0000QAAAAAAAAAA-0--
d1wh8a_ (res13 - res90)
		Z-Score: 1.0 AR: 46 RMSD: 3.4A SI:  11%	P-Value: 0.02 EP: 63 RMSD: 2.36A Twist: 2		Qry: VKPHPYGVDREEIKILINNLKRDYTIKEFLVNEFQSIGDTTADKILELAGLKPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDF D2 : --00QABG0QAAAAAAAAB0RGR00QAAAAB0BG0R00QAAAAAAAAABR00QB00QAB00QAAAAAAAAAAAG0R-- LCS: --00QABG0QAAAAAAAAB-R--00QAAAAB0--0R00QAAAAAAA--B-00--00QAB0-QAAAAAAAAA------- Tgt: APGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWL D2 : --00QAAAAABG000RQAAAAAAAAAAAAABR00QAAAAAB00R00QAAAAAAAB0000QABG0QAABQAAAAAAA-- LCS: --00QA----BG0---Q-----AAAAAAAABR00QAAAA-B00R00QAAAAAAAB0000QAB-0QAA--AAAAAAA--

[The D² code]

• 0 = DDDDD    (Extended strand, small blue spheres)
• 1 = DDDDU
• 2 = DDDUD
• 3 = DDDUU
• 8 = DUDDD
• 9 = DUDDU
• A = DUDUD    (Helix, large red spheres)
• B = DUDUU    (C-cap, large orange spheres)
• G = UDDDD    (Large green spheres)
• H = UDDDU
• I = UDDUD
• J = UDDUU
• O = UUDDD
• P = UUDDU
• Q = UUDUD    (N-cap, large orange spheres)
• R = UUDUU    (Turn, large yellow spheres)